2005年吞吐量为1,380,000TEU，比上年下降了4.2%，世界排名第六十六位。

尽管2005年南安普敦港吞吐量下降了4％，但是，由于马士基航运集团重组了在英国的航线，使南安普敦港2006年的吞吐量又上升了。

大航运联盟也在2006年9月决定加强英国的业务，在南安普敦港增加了6条航线，预计年吞吐量可增加20％。

为迎接吞吐量的增长，南安普敦港集装箱码头计划投资1500万英镑（约合2800万美元），新配置2台桥吊和8台场地龙门吊。另外，该码头还对现有的11台桥吊延长了外伸距，以便能对18个集装箱宽度的船舶作业。

各种设施的改善已缓解了南安普敦港集装箱码头交通堵塞的瓶颈，并为该港吞吐量的持续增长打下了坚实的基础，预计年吞吐量将达到200万TEU。

目前，南安普敦港已向英国港埠协会提出申请，希望在该港新建一个近海运输码头。